MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 5263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017327	GCT	2	6	2296	2301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017327	TCG	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017327	CCT	2	6	3699	3704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017327	CGG	2	6	3746	3751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017327	CGC	2	6	3772	3777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017327	AC	3	6	3787	3792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017327	GTC	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017327	AACG	2	8	3821	3828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017327	AGG	2	6	4271	4276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017327	GTT	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017327	GGCC	2	8	4371	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017327	TGC	2	6	4394	4399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017327	GCC	2	6	4419	4424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017327	TTA	2	6	5205	5210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017327	GGT	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017327	CGG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017327	AT	3	6	8011	8016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017327	T	6	6	8019	8024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017327	ACT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017327	T	6	6	8052	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017327	AAT	2	6	8644	8649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017327	CT	3	6	10105	10110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017327	CAC	2	6	10124	10129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017327	TGA	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017327	GGC	2	6	10857	10862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017327	TCGC	2	8	10903	10910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017327	GGT	2	6	10941	10946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017327	GTG	2	6	10953	10958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017327	T	7	7	10982	10988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017327	CGC	2	6	10994	10999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017327	GC	3	6	11017	11022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017327	GCT	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017327	CGA	2	6	14699	14704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017327	CGG	2	6	14712	14717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017327	CG	3	6	14735	14740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017327	TCCG	2	8	14781	14788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017327	GA	3	6	21790	21795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017327	AGC	2	6	22871	22876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017327	CGTT	2	8	22993	23000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017327	GGT	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017327	TGC	2	6	24499	24504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017327	GAC	2	6	24528	24533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017327	CTCGAT	2	12	24990	25001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017327	TGC	2	6	25033	25038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017327	ATG	2	6	25093	25098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017327	GCT	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017327	GTG	3	9	25170	25178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017327	ACGA	2	8	25230	25237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017327	CGT	2	6	25258	25263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017327	GTC	2	6	25277	25282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017327	TGA	2	6	25329	25334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017327	CGGG	2	8	25336	25343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017327	GCG	2	6	25435	25440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017327	CGT	2	6	25545	25550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017327	AAC	2	6	25560	25565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017327	GCC	3	9	27565	27573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017327	AT	3	6	27603	27608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017327	CAA	2	6	27612	27617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017327	GTT	2	6	27681	27686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017327	ATT	2	6	27721	27726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017327	CT	3	6	27821	27826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017327	GTT	2	6	27837	27842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017327	TGCC	2	8	27918	27925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017327	CGG	2	6	27930	27935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017327	ACCG	2	8	28334	28341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017327	CCTA	2	8	28344	28351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017327	GTGC	2	8	28391	28398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017327	ACTC	2	8	28423	28430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017327	CGT	2	6	28455	28460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017327	TAA	2	6	28467	28472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017327	CTG	2	6	28494	28499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017327	TCC	2	6	28577	28582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017327	TCCG	2	8	28645	28652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017327	CGCT	2	8	28656	28663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017327	GCA	2	6	28725	28730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017327	GCC	2	6	28740	28745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017327	CAG	3	9	28760	28768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017327	GAG	2	6	28786	28791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017327	TGA	2	6	28904	28909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017327	T	6	6	28932	28937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017327	GAC	2	6	28963	28968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017327	ATTTT	2	10	29031	29040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017327	CCG	2	6	29058	29063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017327	TGC	2	6	29098	29103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017327	TGT	2	6	29145	29150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017327	CCT	2	6	29176	29181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017327	GCGA	2	8	29200	29207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017327	TCC	3	9	29212	29220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017327	CTC	3	9	29247	29255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017327	CCT	2	6	29295	29300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017327	CTT	2	6	30530	30535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017327	GAC	2	6	30564	30569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017327	CAC	2	6	30610	30615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017327	TGA	2	6	34440	34445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017327	CGC	2	6	34484	34489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017327	TTG	2	6	34500	34505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017327	CAA	2	6	34585	34590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017327	TCCCGA	2	12	34661	34672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017327	GGC	2	6	34700	34705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017327	AGA	2	6	34726	34731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017327	CAT	2	6	34751	34756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017327	GTT	2	6	34766	34771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017327	TCG	2	6	36459	36464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017327	TGA	2	6	37267	37272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017327	AGC	2	6	37311	37316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017327	CCG	2	6	38605	38610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017327	CG	3	6	38609	38614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017327	A	6	6	46468	46473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017327	AGC	2	6	46476	46481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017327	CG	3	6	46519	46524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017327	TCG	2	6	46545	46550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017327	CAA	2	6	46556	46561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017327	ACTCG	2	10	47120	47129	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017327	ACG	2	6	47130	47135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017327	CCA	2	6	47145	47150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017327	TG	3	6	47200	47205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017327	TTGCCG	2	12	47206	47217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017327	ACCA	2	8	47352	47359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017327	TCG	2	6	49760	49765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017327	GAA	2	6	49839	49844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017327	GTAA	2	8	49878	49885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017327	CGC	2	6	49894	49899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017327	CGC	2	6	49939	49944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017327	TTTGG	2	10	53682	53691	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017327	ATGG	2	8	53697	53704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017327	CGG	2	6	53742	53747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017327	ACGT	2	8	53759	53766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017327	TCC	2	6	53809	53814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017327	TCC	2	6	53848	53853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017327	GCC	2	6	53862	53867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017327	GC	3	6	53967	53972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017327	ATTTA	2	10	54005	54014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017327	AAAAT	2	10	54016	54025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017327	GC	3	6	55208	55213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017327	GCC	2	6	55237	55242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017327	CGA	2	6	56643	56648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017327	GC	3	6	56703	56708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017327	GC	3	6	56710	56715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017327	TGT	2	6	56738	56743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017327	GCCGG	2	10	56745	56754	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017327	AGAA	2	8	56816	56823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017327	CATT	2	8	56855	56862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017327	AAG	2	6	56906	56911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017327	GAC	2	6	56916	56921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017327	CTT	2	6	56932	56937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017327	GGC	2	6	56952	56957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017327	CCG	2	6	56960	56965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_017327	CAC	2	6	56980	56985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017327	ATC	2	6	56987	56992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017327	CG	3	6	56999	57004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017327	AGG	2	6	57033	57038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017327	CG	3	6	57889	57894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017327	GGC	2	6	57897	57902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_017327	CCA	2	6	58769	58774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_017327	CGA	2	6	60862	60867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_017327	GAA	2	6	63426	63431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_017327	CCG	2	6	67829	67834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_017327	TCC	2	6	67852	67857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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181	NC_017327	AGG	3	9	69382	69390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017327	AG	5	10	69584	69593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_017327	CCGTA	2	10	95390	95399	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_017327	ATG	2	6	95411	95416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017327	GAC	2	6	95420	95425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_017327	GCT	2	6	95469	95474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017327	ACGA	2	8	95548	95555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
286	NC_017327	CGT	2	6	95594	95599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_017327	G	6	6	95678	95683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
290	NC_017327	GCT	2	6	95727	95732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_017327	TGA	2	6	125208	125213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017327	CAA	2	6	129948	129953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_017327	GGC	2	6	130998	131003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_017327	CTT	2	6	131030	131035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_017327	CCGG	2	8	131100	131107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
467	NC_017327	GT	3	6	132304	132309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_017327	TCTT	2	8	132755	132762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
474	NC_017327	TCAA	2	8	132764	132771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
475	NC_017327	CCG	2	6	132772	132777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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485	NC_017327	CAGC	2	8	135257	135264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_017327	TCT	2	6	136230	136235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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